Particularmente cuando se administran dosis más altas que las indicadas de Fluticasona y durante largos periodos de tiempo, pueden presentarse efectos sistémicos que es mucho menor que con los corticosteroides orales. Los efectos sistémicos que pueden darse incluyen: síndrome de Cushing, signos y síntomas cushingoides, supresión suprarrenal, retraso del crecimiento en niños y adolescentes, disminución de la densidad mineral ósea, cataratas y glaucoma y con una frecuencia más rara, diversos efectos psicológicos y conductuales, entre los que se incluye la hiperactividad psicomotora, alteraciones del sueño, ansiedad, depresión o agresividad (especialmente en niños).
Ciertos individuos pueden mostrar mayor susceptibilidad a los efectos de los corticosteroides. La función y la reserva adrenal usualmente permanecen dentro del rango normal con las dosis recomendadas de Flucomix. En caso de infecciones locales de las fosas nasales, estas deben tratarse adecuadamente, pero no constituyen una contraindicación específica para el tratamiento con Flucomix en raras ocasiones puede producir una disfonía de poca trascendencia. No obstante, debe tenerse en cuenta el riesgo potencial de enmascarar una infección local.
